Hej,
Jag är inte säker på att jag helt förstår din fråga. Men här är några saker att kolla.
Utöver ”vanliga” tillägg, vars filer brukar ligga under /wp-content/plugins/ kan det finnas tillägg som automatiskt körs varje gång. De visas inte i listan över tillägg och kan därmed inte enkelt inaktiveras inifrån WordPress-panelen. Kolla webbplatsens filstruktur (t.ex. via FTP) för att se om det finns några tillägg under /wp-content/mu-plugins/
Filen .htaccess kan innehålla extra parametrar för hur webbservern Apache körs. Om du raderar (eller byter namn på) denna fil, så kommer WordPress att skapa en ny automatiskt när du besöker adminpanelens inställningar för val av URL-struktur. Om du raderar denna fil, se till att spara en kopia för säkerhets skull. Bland annat tillägg som på olika sätt ska hjälpa till att skydda din webbplats kan lägga in en hel del extra regler i denna fil. Någon gång ibland kan något bli fel, men resultatet är väl i så fall att något inte alls fungerar.
Rent teoretiskt kan det finnas en .htaccess i varje katalog på webbplatsen, men WordPress använder bara grundkatalogen (roten).
Om du besöker din webbplats med någon av de vanliga webbläsarna på datorn kan du under webbläsarens verktyg för utvecklare kolla om det finns några filer som tar lång tid att hämta.
Nästa steg är att använda verktyg som mäter om det finns frågor till databasen som tar lång tid att få svar på.